一、關于創新醫療器械特別審批申請時間問題
依據《創新程序》，食品藥品監管總局對醫療器械注冊申請前，已申請創新醫療器械特別審批的，按照《創新程序》相應要求予以辦理。
二、關于第一類醫療器械是否按照《創新程序》辦理問題
根據《醫療器械監督管理條例》（國務院令第680號），第一類醫療器械實施備案管理，不屬于行政許可事項，因此第一類醫療器械不適用《創新程序》。
對于第一類醫療器械申請創新醫療器械特別審批的，食品藥品監管總局不予受理；已被食品藥品監管總局受理的創新醫療器械特別審批申請，經審查，如申請產品被界定為第一類醫療器械，則不按照《創新程序》進行審批。
三、關于延續注冊/許可事項變更是否適用《創新程序》問題
依據《創新程序》第十二條、第十四條、第十七條，創新醫療器械特別審批僅適用于《醫療器械注冊管理辦法》（食品藥品監管總局令第4號）、《體外診斷試劑注冊管理辦法》（食品藥品監管總局令第5號）所明確的醫療器械首次注冊形式，不適用于延續注冊或者許可事項變更形式。
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